Естественнонаучная коллекция, а первоначально гербарный фонд явился тем первым краеугольным камнем, с чего начинался музей местного края. До революции именно эта коллекция была самой значимой его частью.
В настоящее время естественнонаучная коллекция включает в себя объекты живой и неживой природы, собранные на протяжении последних 50 лет. Сейчас в коллекции представлены большое количество образцов минералов и горных пород, окаменевшие остатки растений и животных.
